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Gites
Les microchiroptères ne construisent pas leur habitat. Ils s’adaptent à des gîtes pré-existants : greniers, caves, troncs d’arbres ... ou des sites naturels : cavités artificielles (mines ...) ou naturelles (grottes). Au même titre que les territoires de chasse, les gîtes des chauves-souris présentent des caractéristiques de structures et de microclimats répondant aux exigences des diverses espèces.
- Un Murin de Bechstein dans une grotte
Certaines espèces utilisent uniquement les milieux souterrains, d’autres vivent en milieu forestier ou d’autres se sont adaptées au milieu urbain, c’est le cas en Haute-Saône des Noctules qui squattent les H.L.M. et y gîtent une grande partie de l’année. La Sérotine commune s’installe dans ces deux types de milieux et cohabite souvent avec les Pipistrelles au revers des volets et sous les lambris recouvrant les murs de certaines maisons.